Werking in prokaryoten
In prokaryote cellen, zoals de bacterie Eschericia Coli, wordt de transcriptie op bepaalde plaatsen in het DNA als het ware aan- en uitgezet door de promotor, de TATA-box, een zogenaamde consensussequentie. Deze heet zo omdat de sequentie "TATA" er vaak in voorkomt (elke letter staat voor een nucleotide, zie DNA).
stroomopwaarts ~17 basendoelwit-gen stroomafwaarts 5'----------|-35|---------|-10|----------------------|T|------------3' 3'----------|-35|---------|-10|----------------------|T|------------5' | |---------------------> RNA
Het gedeelte tussen -35 en -10 noemt men de "TATA-box". RNA polymerase herkent de TATA-box en bindt eraan. Vervolgens begint de transcriptie 10 basenparen verderop. Bij bacterien beginnen ribosomen ook in 5' naar 3' richting direct met de eiwitsynthese terwijl het RNA nog getranscribeerd wordt.
Eukaryote transcriptie
Transcriptie in eukaryote cellen, zoals die van de mens, is een stuk ingewikkelder. Er zijn zogenaamde enhancers, zoals de GC-box, en silencers aanwezig op het DNA die de snelheid van transcriptie en zo de mate van expressie van het gen bepalen. Ook omvat het transcriptie-complex naast RNA polymerase nog veel meer eiwitten: de activatoren (zoals Sp1), coactivatoren, een TATA-bindend eiwit en vijf andere basale factoren.