Sierra
La sierra se caracteriza por la presencia de alpacas, llamas, guanacos y vicuñas, cuya utilidad económica es la de suministrar lana y carne a la población. De igual forma en esta región se registran venados, chinchillas y vizcachas. En los lagos se tiene aves como las gaviotas, parihuanas, patillos y zambullidoras.
Selva
La selva tiene una fauna diversificada, destacando la presencia del jaguar, puma, grandes serpientes, cocodrilos, jabalíes, papagallos, loros, miles de aves y especies aún desconocidas. El Río Amazonas, teien especies de toda naturaleza aún por clasificar. En los ríos existen caimanes y tortugas, pero su pesca está prohibida.
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