Archaea
Son organismos celulares que carecen de nucleo como el resto de los Procariotas, se separan de las Eubacterias por las grandes diferencias existentes en el análisis de los ARNr (ARN ribosomal,) y la presencia de lípidos peculiares. Comprenden organismos productores de metano (metanógenos), Halófilos extremos, Termo-acidófilos, en los últimos tiempos, se han encontrado multitud de especies en los océanos. Se las considera más proximas a los eucariotas que a las eubacterias.
Son muy fecuentes en los océanos, también son frecuentes en hábitats extremos, Halococcus y Halobacterium solo viven en medios con más del 12 % de sal (mucho más salado que el agua de mar); los termo-acidófilos necesitan temperaturas de más de 60-80º C, con un pH bajo, de 1-3: Sulfolobus acidocaldarius oxida el azufre y vive en las fuentes termales del parque Yellowstone, Termoplasma se encuentra en escombreras de carbón encendidas (ardiendo).
Presentan envolturas características, unas veces formadas por proteínas y polisacáridos, vainas de proteína o pseudomureína (es característica de las arqueobacterias la falta de mureína, lípidos ramificados, con enlace éter, que contienen fitano.
También es característica la presencia de ARN-polimerasas de constitución compleja y un gran número de nucleótidos modificados en los ácidos nucleicos ribosomales.
La sistemática de las arqueobacterias no esta completa y las diferencias entre algunos grupos es muy grande.
Se proponen tres reinos, pero dado el escaso conocimiento actual sobre las especies de este dominio, el número de reinos puede aumentar con rapidez:
