Su asesinato
Lincoln tuvo reuniones con frecuencia con Grant mientras terminaba la guerra. Los dos hombres planearon asuntos de la reconstrucción, y era evidente para todos que los dos hombres se tuvieron un gran respeto el uno al otro. Durante su última reunión, el 14 de abril de 1865, Lincoln invitó al General Grant a un evento social para aquella tarde. Grant rechazó la invitación (su esposa no deseaba gastar el tiempo con Mary Todd Lincoln).
Sin el General y su esposa, Lincoln y su esposa salieron para asistir a un drama en el teatro de Ford. La obra era Nuestro Primo Americano, una comedia musical. Cuando Lincoln se sentó en el balcón, John Wilkes Booth, un actor y simpatizante del Sur de Virginia, disparó un único tiro, con pistola de bala redonda a la cabeza del presidente. ¡Él gritó "Sic semper tyrannis! " (Latín: "así siempre a tiranos" y es el lema del estado de Virginia). Booth saltó desde el balcón al escenario, rompiendose una pierna.
Booth alcanzó cojeando su caballo y se fugó, y el presidente, mortalmente herido , fue llevado a una casa atravesando la calle donde entró en coma durante algún tiempo antes de fallecer. Booth y varios de sus compañeros (se demostró más tarde que algunos de ellos que eran inocentes) fueron finalmente capturados y ahorcados o encarcelados.
El cuerpo de Lincoln fue llevado por tren en una magnífica procesión fúnebre por varios estados. La nación se afligió por un hombre, al que muchos consideraron el salvador de los Estados Unidos y el protector y el defensor de lo que Lincoln mismo llamó "el gobierno de la gente, por la gente, y para la gente." Los más críticos argumentan que de hecho eron los confederados los que estaban defendiendo el derecho del "gobierno para la gente" y que fue Lincoln quien suprimió ese derecho. Incluso insisten en que Lincoln sólo preservó la unión en un sentido geográfico a la vez que destruyó su naturaleza voluntaria.

El tren de cortejo fúnebre de Lincoln.
El tren que llevó el cuerpo de Lincoln de Washington, D.C. a Illinois fue visto por más de siete millones de personas, casi un quinto de la población de los Estados Unidos en aquel tiempo.